Naknek znajduje się na północnym brzegu rzeki Naknek, w północno-wschodniej części Bristol Bay. Miejscowość oddalona jest o 297 mil na południowy zachód od Anchorage. Region ten został po raz pierwszy zasiedlony ponad 6000 lat temu przez Eskimosów Yup’ik i Indian Athabascan.W 1821 roku wieś „Naugeik” została zauważona przez kapitana Wasiliewa. W 1880 roku została nazwana Kinuyak, następnie jej nazwę zmieniła na Naknek rosyjska marynarka wojenna. W różnych okresach swojej historii Naknek nazywano: Naugvik, Kinghiak, Libbyville, Pawik i Suworowa (pisownia również Suwarof lub Suworof). Rosjanie zbudowali fort w pobliżu wsi. Przed zakupem Alaski przez USA wieś zamieszkiwali łowcy futer.
Pierwsza fabryka konserw z łososia została otwarta w Naknek River w 1890 roku. W roku 1900 było już około 12 fabryk w Bristol Bay. Pierwsze akta ziemskie w tym rejonie nabywały fabryki przetwórstwa rybnego (grunty pod przetwórnie) oraz Rosyjski Kościół Prawosławny na północnym brzegu rzeki w Naknek, zachęcając do osiedlania się w tym regionie.
Wioska rozwijała się na obszarze zasięgu rosyjskiej Cerkwi. Osadnicy budowali szałasy na ziemiach należących do Prawosławnego Kościoła, dzięki czemu mieli możliwość odkupienia tych działek, leżących w centrum Naknek.
Demografia
Według spisu z 2000 roku wieś zamieszkiwało 678 osób. Gęstość zaludnienia wynosi 8,1 osoby na milę kwadratową (3.1/km ²). Rasowy podział w Naknek wygląda następująco: 51,47% biali, 45,28% stanowią rdzenni Amerykanie, 0,15% Azjaci, 0,74% mieszkańcy Pacyfiku, 2,36% i od dwóch lub więcej ras, 0,29% ludności to Hiszpanie lub Latynosi.
Poczta powstała w 1907 roku i przez lata Naknek rozwijało się jako duży ośrodek rybołówstwa. Lokalna gospodarka jest niemal w całości oparta na połowach łososia.
